20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2555 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2555  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  279  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356982  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0737  hypothetical protein  48.23 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02620  hypothetical protein  41.38 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0396  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  97.4  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1159  hypothetical protein  43.48 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3661  hypothetical protein  39.46 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6869  hypothetical protein  35.04 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.640003  normal  0.119892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0897  hypothetical protein  34.75 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5793  hypothetical protein  30.71 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3253  hypothetical protein  38.17 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4139  hypothetical protein  31.65 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24606  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4171  hypothetical protein  32 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000102963  hitchhiker  0.000000290643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3775  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0018527  hitchhiker  0.00917662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2059  hypothetical protein  30.99 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.535372  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0746  hypothetical protein  31.21 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2548  hypothetical protein  30.5 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0181  hypothetical protein  31.13 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000752164  normal  0.677539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1109  hypothetical protein  25.2 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000177487  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0023  hypothetical protein  27.46 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1779  hypothetical protein  31.47 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155662  normal  0.0336691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>