23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0550 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0550  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1068    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0549  hypothetical protein  54.34 
 
 		 542 aa  588  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2733  hypothetical protein  49.62 
 
 		 570 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  hitchhiker  0.00174807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1617  hypothetical protein  46.11 
 
 		 579 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0336  hypothetical protein  44.98 
 
 		 492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0136782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0552  hypothetical protein  44.85 
 
 		 504 aa  440  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.677753  normal  0.24778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0551  hypothetical protein  43.5 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0557  hypothetical protein  39.66 
 
 		 487 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2081  hypothetical protein  35.46 
 
 		 444 aa  277  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0297326  normal  0.252224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0555  hypothetical protein  39.74 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.589483  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0556  hypothetical protein  38.34 
 
 		 515 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.253273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2082  hypothetical protein  39.05 
 
 		 476 aa  273  8.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  0.181535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2083  hypothetical protein  34.18 
 
 		 493 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  0.196729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0337  hypothetical protein  37.98 
 
 		 448 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0558  hypothetical protein  37.66 
 
 		 467 aa  249  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.675961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2732  hypothetical protein  34.01 
 
 		 449 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  hitchhiker  0.00119476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1618  hypothetical protein  35.68 
 
 		 475 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.483238  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0548  hypothetical protein  35.26 
 
 		 390 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5342  hypothetical protein  33.58 
 
 		 426 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0256  DoxX family protein  26.36 
 
 		 448 aa  89.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4334  hypothetical protein  24.13 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06020  hypothetical protein  26.09 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.305074  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0868  hypothetical protein  20.17 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>