23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0549 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0549  hypothetical protein  100 
 
 
542 aa  1106    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0550  hypothetical protein  54.34 
 
 
523 aa  598  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2733  hypothetical protein  52.54 
 
 
570 aa  558  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  hitchhiker  0.00174807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1617  hypothetical protein  50 
 
 
579 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0336  hypothetical protein  49.52 
 
 
492 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0136782  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0552  hypothetical protein  50.1 
 
 
504 aa  490  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.677753  normal  0.24778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0551  hypothetical protein  47.78 
 
 
501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0557  hypothetical protein  38.68 
 
 
487 aa  313  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0558  hypothetical protein  39.7 
 
 
467 aa  297  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.675961 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0555  hypothetical protein  39.03 
 
 
442 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.589483  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0556  hypothetical protein  35.4 
 
 
515 aa  278  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.253273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2081  hypothetical protein  39.54 
 
 
444 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0297326  normal  0.252224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2082  hypothetical protein  39.49 
 
 
476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  0.181535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2732  hypothetical protein  36.03 
 
 
449 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  hitchhiker  0.00119476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2083  hypothetical protein  35.9 
 
 
493 aa  266  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  0.196729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0337  hypothetical protein  38.27 
 
 
448 aa  259  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058195  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1618  hypothetical protein  35.93 
 
 
475 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.483238  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0548  hypothetical protein  36.94 
 
 
390 aa  230  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5342  hypothetical protein  33.46 
 
 
426 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0256  DoxX family protein  28.68 
 
 
448 aa  95.1  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0868  hypothetical protein  25.32 
 
 
459 aa  68.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4334  hypothetical protein  27.97 
 
 
445 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06020  hypothetical protein  26.02 
 
 
353 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.305074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>