16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0339 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0339  hypothetical protein  100 
 
 
639 aa  1315    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.809143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4071  hypothetical protein  29.79 
 
 
640 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184175  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0364  hypothetical protein  28.48 
 
 
683 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614436  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2958  hypothetical protein  27.53 
 
 
609 aa  142  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725385  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2475  hypothetical protein  27.09 
 
 
611 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.641856  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1656  hypothetical protein  24.55 
 
 
627 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.558221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3877  hypothetical protein  30.61 
 
 
546 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.413132  normal  0.0515255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3685  hypothetical protein  28.24 
 
 
549 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0276  hypothetical protein  26.67 
 
 
561 aa  49.7  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3673  hypothetical protein  30.61 
 
 
546 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0272  hypothetical protein  30.61 
 
 
546 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4062  hypothetical protein  28.04 
 
 
548 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4180  hypothetical protein  28.04 
 
 
548 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3984  hypothetical protein  30.61 
 
 
548 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4093  hypothetical protein  29.59 
 
 
548 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0306  hypothetical protein  30 
 
 
503 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>