18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0656 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0656  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  593  1e-168  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1444  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.9 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  25.2 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  22.65 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  21.38 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  23.79 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  25.21 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  23.05 
 
 
350 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  22.89 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  20 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  22.03 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  21.49 
 
 
321 aa  52.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  21.25 
 
 
331 aa  52.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  18.75 
 
 
349 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  21.31 
 
 
319 aa  47  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  21.31 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  20.38 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  16.37 
 
 
323 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>