11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1280 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1280  invasion antigen B  100 
 
 
606 aa  1236    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1368  invasion antigen B  55.21 
 
 
606 aa  689    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1643  hypothetical protein  58.28 
 
 
608 aa  752    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2148  lipoprotein signal peptidase  57.69 
 
 
614 aa  716    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0921  invasion antigen B  51.89 
 
 
610 aa  627  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000430425  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0992  invasion antigen B  51.72 
 
 
610 aa  623  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.442669  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0900  invasion antigen B  51.89 
 
 
607 aa  622  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000206043  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1268  invasion antigen B  50.41 
 
 
611 aa  617  1e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00539519  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1848  CiaB protein  42.17 
 
 
621 aa  475  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2237  MutT/NUDIX family protein  28.45 
 
 
565 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0855857  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03446  putative orphan protein  26.41 
 
 
564 aa  44.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>