25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1960 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1960  flagellar assembly protein FliW  100 
 
 
127 aa  258  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1592  flagellar assembly protein FliW  92.91 
 
 
127 aa  242  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1068  flagellar assembly protein FliW  61.42 
 
 
128 aa  174  3e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253776  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0858  protein of unknown function DUF180  51.18 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0648  flagellar assembly protein FliW  49.61 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.486344  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1093  flagellar assembly protein FliW  49.61 
 
 
129 aa  133  9e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1218  flagellar assembly protein FliW  49.61 
 
 
129 aa  133  9e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.462259  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0959  flagellar assembly protein FliW  45.74 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0412  flagellar assembly protein FliW  42.97 
 
 
126 aa  97.8  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0098  flagellar assembly protein FliW  34.86 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  35.34 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  28.7 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  30.28 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  35.24 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2416  hypothetical protein  28.97 
 
 
136 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0749  hypothetical protein  28.44 
 
 
158 aa  50.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.746617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  29.66 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  26.5 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  32.71 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  32.11 
 
 
165 aa  44.3  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  29.66 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0866  flagellar assembly protein FliW  28.81 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  29.75 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0843  flagellar assembly protein FliW  27.35 
 
 
149 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  27.71 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>