19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1507 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1507  rare lipoprotein B precursor  100 
 
 
183 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0236353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0672  hypothetical protein  98.36 
 
 
206 aa  370  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00531564  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  27.45 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  27.45 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  26.11 
 
 
161 aa  49.3  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  23.53 
 
 
177 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  26.61 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  33.06 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0704  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.77 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.712434  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0750  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.77 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0690  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.77 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0364606  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0807  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.77 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.914545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0763  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.77 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447901  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  28.57 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.96 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.28 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  25.89 
 
 
183 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1556  rare lipoprotein B  30.67 
 
 
167 aa  42  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.22375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.27 
 
 
184 aa  42  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>