16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13153 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13153  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  442  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0280148  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4595  hypothetical protein  67.53 
 
 
212 aa  289  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.6728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0450  hypothetical protein  56.54 
 
 
220 aa  266  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1596  hypothetical protein  58.57 
 
 
220 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1353  hypothetical protein  54.42 
 
 
219 aa  248  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.187425  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4064  hypothetical protein  52.06 
 
 
218 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0129  hypothetical protein  50.75 
 
 
225 aa  223  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1325  hypothetical protein  29 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125239  normal  0.126591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2095  hypothetical protein  36 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  26.02 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  26.02 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  26.02 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  24 
 
 
255 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0088  hypothetical protein  26.5 
 
 
235 aa  58.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235222  normal  0.0227484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3492  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 
236 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0306  A-macroglobulin complement component  26.79 
 
 
827 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>