37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12318 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  1042    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  57.14 
 
 		 508 aa  602  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  44.27 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  42.38 
 
 		 510 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  42.52 
 
 		 521 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  42.38 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  33.26 
 
 		 484 aa  279  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  30.77 
 
 		 502 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  30.46 
 
 		 507 aa  250  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  30.8 
 
 		 509 aa  249  1e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  31.39 
 
 		 495 aa  235  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  30.91 
 
 		 497 aa  235  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  30.24 
 
 		 502 aa  233  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  30.52 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  30.79 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  30.53 
 
 		 508 aa  231  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  29.52 
 
 		 502 aa  229  1e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  30.18 
 
 		 514 aa  226  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  30.18 
 
 		 514 aa  226  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  30.43 
 
 		 510 aa  226  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  31.26 
 
 		 496 aa  226  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  29.28 
 
 		 504 aa  223  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  29.61 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  28.93 
 
 		 500 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  29.25 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  29.84 
 
 		 497 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  27.84 
 
 		 507 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  29.96 
 
 		 562 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  29.98 
 
 		 527 aa  203  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  29.39 
 
 		 530 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  27.64 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  30.02 
 
 		 528 aa  196  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  28.54 
 
 		 539 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  23.4 
 
 		 528 aa  177  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  22.92 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  26.64 
 
 		 586 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  32.2 
 
 		 557 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>