17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12173 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12173  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  724    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4660  hypothetical protein  26.12 
 
 
322 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6305  hypothetical protein  26.3 
 
 
331 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0866  hypothetical protein  23.16 
 
 
406 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4814  hypothetical protein  24.32 
 
 
425 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0582  hypothetical protein  22.92 
 
 
354 aa  89.7  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1312  hypothetical protein  23.66 
 
 
347 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2038  hypothetical protein  34.74 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0511  hypothetical protein  33.04 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3152  hypothetical protein  34.78 
 
 
466 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.416399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2453  hypothetical protein  31.87 
 
 
233 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.438658  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2578  hypothetical protein  27.66 
 
 
280 aa  60.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.149067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0075  hypothetical protein  24.08 
 
 
343 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0582  hypothetical protein  21.93 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0242426  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1391  hypothetical protein  32.22 
 
 
245 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2336  hypothetical protein  24.73 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0899485  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_002950  PG1943  hypothetical protein  25.29 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>