15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11403 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11403  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  604  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.306099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2866  hypothetical protein  33.74 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3751  hypothetical protein  34.98 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1412  hypothetical protein  32.14 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2479  hypothetical protein  30.42 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.322617  normal  0.362973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2539  hypothetical protein  32.46 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1216  hypothetical protein  29.53 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.256676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0932  hypothetical protein  26.48 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0973643 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0819  hypothetical protein  27.6 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1201  hypothetical protein  27.59 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.800385  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  38.71 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  40.32 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  38.71 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0313  SdiA-regulated domain-containing protein  38.71 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  34.38 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>