19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02620 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02620  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  291  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0737  hypothetical protein  47.45 
 
 
140 aa  130  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2555  hypothetical protein  41.38 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356982  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0396  hypothetical protein  40.97 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3661  hypothetical protein  32.12 
 
 
155 aa  84  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0897  hypothetical protein  32.62 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3253  hypothetical protein  36.88 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1159  hypothetical protein  33.03 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4171  hypothetical protein  32.81 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000102963  hitchhiker  0.000000290643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5793  hypothetical protein  29.63 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6869  hypothetical protein  30.28 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.640003  normal  0.119892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4139  hypothetical protein  27.94 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24606  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2548  hypothetical protein  27.61 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0815  hypothetical protein  20.74 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2059  hypothetical protein  31.21 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.535372  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4463  hypothetical protein  20.74 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235508  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3775  hypothetical protein  25.19 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0018527  hitchhiker  0.00917662 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0023  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1779  hypothetical protein  32.85 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155662  normal  0.0336691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>