45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00655 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  100 
 
 		 484 aa  1007    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  68.74 
 
 		 507 aa  729    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  65.76 
 
 		 502 aa  698    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  53.83 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  51.96 
 
 		 510 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  49.38 
 
 		 507 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  50.1 
 
 		 504 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  50.73 
 
 		 504 aa  519  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  48.44 
 
 		 508 aa  508  1e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  50.11 
 
 		 509 aa  504  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  39.83 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  37.14 
 
 		 495 aa  353  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  38.2 
 
 		 500 aa  342  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  37.84 
 
 		 510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  37.05 
 
 		 497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  36.58 
 
 		 497 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  36.92 
 
 		 500 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  37.13 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  35.89 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  33.61 
 
 		 514 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  33.61 
 
 		 514 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  33.54 
 
 		 510 aa  281  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  33.26 
 
 		 507 aa  279  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  31.93 
 
 		 514 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  32.34 
 
 		 522 aa  273  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  32.71 
 
 		 521 aa  270  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  32.64 
 
 		 508 aa  269  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  34.3 
 
 		 512 aa  263  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  32.31 
 
 		 562 aa  246  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  29.94 
 
 		 528 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  31.21 
 
 		 527 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  29.76 
 
 		 528 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  32.11 
 
 		 539 aa  226  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  30.93 
 
 		 530 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  23.44 
 
 		 586 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  24.73 
 
 		 557 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  21.24 
 
 		 581 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  22.11 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  28.16 
 
 		 559 aa  64.3  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  20.69 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  28.71 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  25 
 
 		 128 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  28.21 
 
 		 509 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2176  hypothetical protein  28.21 
 
 		 509 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  23.3 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>