17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1463 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1463  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2347  hypothetical protein  85.64 
 
 
202 aa  359  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.80228  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7752  hypothetical protein  75.25 
 
 
275 aa  327  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384713  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7807  hypothetical protein  74.75 
 
 
275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1428  hypothetical protein  67.36 
 
 
196 aa  267  8.999999999999999e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3649  hypothetical protein  56.99 
 
 
196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0105  hypothetical protein  55.96 
 
 
195 aa  214  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1510  hypothetical protein  53.37 
 
 
197 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0590557  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1228  hypothetical protein  53.37 
 
 
197 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0411  hypothetical protein  50.26 
 
 
196 aa  201  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.515646  normal  0.176286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5910  hypothetical protein  49.74 
 
 
202 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8911  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1785  hypothetical protein  45.14 
 
 
176 aa  157  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1889  hypothetical protein  43.58 
 
 
176 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.887435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1175  hypothetical protein  34.62 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0077  hypothetical protein  32.42 
 
 
179 aa  108  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.541745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01360  hypothetical protein  23.6 
 
 
187 aa  45.1  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1419  hypothetical protein  23.26 
 
 
185 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>