39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0588 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0588  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147251  normal  0.641101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1429  hypothetical protein  75.45 
 
 		 110 aa  171  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411241  normal  0.655732 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4646  integral membrane protein-like  62.26 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3131  hypothetical protein  77.19 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0758  hypothetical protein  68.85 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306085  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3391  hypothetical protein  49.53 
 
 		 98 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6304  hypothetical protein  57.33 
 
 		 95 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2033  hypothetical protein  66.67 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.230623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1243  hypothetical protein  58.33 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2191  hypothetical protein  63.79 
 
 		 92 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  normal  0.810634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5129  hypothetical protein  48.04 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4685  hypothetical protein  63.79 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.238421  normal  0.819427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0304  hypothetical protein  59.7 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237278 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2029  hypothetical protein  65.52 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5939  hypothetical protein  66.67 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.822986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3065  hypothetical protein  60.34 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.516609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5147  hypothetical protein  63.79 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1608  integral membrane protein-like  67.24 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1030  hypothetical protein  58.62 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.89878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0993  hypothetical protein  58.62 
 
 		 95 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0774  hypothetical protein  54.55 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.754477  normal  0.205049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1722  hypothetical protein  58.73 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.685505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1558  hypothetical protein  65.31 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0381215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3132  hypothetical protein  44.34 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0945  putative signal peptide protein  51.72 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.461777 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1614  hypothetical protein  43.1 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1619  hypothetical protein  43.1 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0812  hypothetical protein  53.19 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114629  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002085  putative signal peptide protein  48.15 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00352  hypothetical protein  46.81 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2687  signal peptide protein  41.82 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13267  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02371  signal peptide protein  46.81 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.352612  normal  0.0437387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1005  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2358  putative signal peptide protein  44.68 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4292  putative signal peptide protein  43.64 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4402  signal peptide protein  43.64 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2534  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352088 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0709  hypothetical protein  41.67 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0729  hypothetical protein  41.67 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>