14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4554 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4554  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0706007  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2698  hypothetical protein  92.26 
 
 
155 aa  299  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0894  hypothetical protein  87.1 
 
 
155 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263402 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1542  hypothetical protein  77.12 
 
 
159 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2946  hypothetical protein  70.59 
 
 
155 aa  227  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.896453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1626  hypothetical protein  71.24 
 
 
154 aa  223  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0672235  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0091  hypothetical protein  70.97 
 
 
157 aa  222  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3657  hypothetical protein  66.01 
 
 
154 aa  213  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0218  hypothetical protein  66.01 
 
 
154 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5125  hypothetical protein  42.21 
 
 
184 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8468  hypothetical protein  33.77 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6975  hypothetical protein  34.48 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1698  hypothetical protein  37.32 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09009  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>