15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2488 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2488  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  173  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1752  hypothetical protein  96.59 
 
 
88 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1642  hypothetical protein  71.59 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814175  normal  0.366144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5535  hypothetical protein  65.22 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0149998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6997  hypothetical protein  61.54 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.879649  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4140  hypothetical protein  68.06 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297372  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3721  hypothetical protein  57.61 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.262773  normal  0.226739 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6722  hypothetical protein  52.05 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4881  hypothetical protein  36.94 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000223725  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1610  hypothetical protein  33.04 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1633  hypothetical protein  32.14 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1221  hypothetical protein  33.93 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1700  hypothetical protein  33.93 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1673  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.214967  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4199  hypothetical protein  32.61 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0493901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>