13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1219 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1219  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  269  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344643  normal  0.41142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3394  hypothetical protein  92.31 
 
 
130 aa  253  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557375  normal  0.0300431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4153  hypothetical protein  90.77 
 
 
130 aa  252  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11154  normal  0.0419349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1306  hypothetical protein  90.77 
 
 
130 aa  250  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  0.526594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1441  hypothetical protein  90.77 
 
 
130 aa  250  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2307  hypothetical protein  90.77 
 
 
130 aa  249  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000137352  hitchhiker  0.000138306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0656  hypothetical protein  80.77 
 
 
130 aa  220  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2349  hypothetical protein  77.69 
 
 
130 aa  213  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226748  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0988  hypothetical protein  77.69 
 
 
130 aa  213  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2230  hypothetical protein  76.92 
 
 
130 aa  212  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0939122  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0553  hypothetical protein  71.54 
 
 
130 aa  199  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2825  hypothetical protein  55.38 
 
 
129 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0065  hypothetical protein  32.38 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>