13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1206 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1206  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  275  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467349  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0545  hypothetical protein  88.81 
 
 
135 aa  248  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4160  hypothetical protein  87.41 
 
 
135 aa  244  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0783191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2324  hypothetical protein  92.74 
 
 
135 aa  241  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600501  hitchhiker  0.00000222052 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1425  hypothetical protein  92.56 
 
 
135 aa  236  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  0.484235 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1291  hypothetical protein  94.02 
 
 
135 aa  229  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.777474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2833  hypothetical protein  69.6 
 
 
126 aa  180  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0899389  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2364  hypothetical protein  58.33 
 
 
121 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0976  hypothetical protein  57.5 
 
 
121 aa  141  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2224  hypothetical protein  58.33 
 
 
121 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.2113  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4488  hypothetical protein  44.07 
 
 
120 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59500  hypothetical protein  42.37 
 
 
120 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000347394  hitchhiker  4.99905e-17 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0603  hypothetical protein  30.77 
 
 
177 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>