36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4791 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4791  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0729  hypothetical protein  52.94 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0709  hypothetical protein  50.98 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0845  hypothetical protein  45.31 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4385  hypothetical protein  36.67 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0150663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0119  hypothetical protein  46.43 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3132  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2687  signal peptide protein  40.86 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4776  hypothetical protein  41.79 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000854569 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00352  hypothetical protein  45.28 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1005  putative signal peptide protein  47.62 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4402  signal peptide protein  48.98 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4292  putative signal peptide protein  48.98 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1619  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1614  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2358  putative signal peptide protein  41.54 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02371  signal peptide protein  46.94 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.352612  normal  0.0437387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002085  putative signal peptide protein  43.4 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0945  putative signal peptide protein  45.1 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.461777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0812  hypothetical protein  44.9 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114629  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0725  hypothetical protein  27.96 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0705  hypothetical protein  36.36 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1429  hypothetical protein  36.08 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411241  normal  0.655732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2534  putative signal peptide protein  44.9 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1030  hypothetical protein  45.83 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.89878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2191  hypothetical protein  43.75 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  normal  0.810634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0993  hypothetical protein  45.83 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3065  hypothetical protein  43.75 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.516609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6304  hypothetical protein  43.75 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2960  putative signal peptide protein  48.08 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4685  hypothetical protein  38.46 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.238421  normal  0.819427 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0774  hypothetical protein  38.3 
 
 		 95 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.754477  normal  0.205049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1243  hypothetical protein  36.73 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4646  integral membrane protein-like  28.09 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2033  hypothetical protein  40.43 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.230623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1722  hypothetical protein  36.17 
 
 		 101 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.685505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>