23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3734 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3734  phage GP46  100 
 
 
155 aa  306  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2812  GP46 family protein  46.58 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1472  phage protein GP46  46.58 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1045  phage protein GP46  51.54 
 
 
145 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2734  phage protein GP46  46.58 
 
 
151 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.86914  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2085  phage protein GP46  42.86 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3048  putative bacteriophage protein GP46, Mu-like  48.36 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162081 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1871  GP46 family protein  51.58 
 
 
405 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.881976  hitchhiker  0.000000000000640584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3114  GP46 family protein  50 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2249  phage protein GP46  40.65 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4480  phage protein GP46  40.65 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2252  phage protein GP46  40.65 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2585  phage GP46 family protein  40.74 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3861  phage FluMu protein gp46  41.32 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1161  Phage FluMu protein gp46  58.33 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4588  Phage GP46  53.85 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0742  phage protein GP46  35.66 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0695  phage protein GP46  35.66 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2701  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4483  GP46 family protein  37.78 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.185083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6584  putative bacteriophage protein, GP46-like protein  32.35 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2445  hypothetical protein  32.05 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0186  hypothetical protein  45.76 
 
 
114 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>