20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3192 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3192  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  191  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6474  hypothetical protein  39.02 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3546  hypothetical protein  37.21 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0703945  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5182  hypothetical protein  38.2 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870922  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5720  hypothetical protein  34.09 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470242  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0406  hypothetical protein  32.97 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1286  hypothetical protein  34.09 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3216500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2091  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1968  hypothetical protein  30 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0894  hypothetical protein  31.11 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00183124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4336  hypothetical protein  31.11 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.022904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1705  hypothetical protein  30.68 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3576  hypothetical protein  28.89 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.221494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5212  hypothetical protein  34.52 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2189  hypothetical protein  29.55 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4610  hypothetical protein  27.78 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2377  hypothetical protein  29.89 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0704345  hitchhiker  0.00399163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1930  hypothetical protein  29.76 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1451  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0136066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>