18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1964 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1964  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  873    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2975  hypothetical protein  58.08 
 
 
417 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0496469  normal  0.454814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3258  hypothetical protein  58.69 
 
 
405 aa  471  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2717  protein of unknown function DUF1688  59.48 
 
 
418 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.970888  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5191  hypothetical protein  59.39 
 
 
392 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.296322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5280  hypothetical protein  59.39 
 
 
392 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5572  hypothetical protein  59.39 
 
 
392 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537709  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2662  protein of unknown function DUF1688  59.19 
 
 
471 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0729613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0314  hypothetical protein  55.58 
 
 
442 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0466  protein of unknown function DUF1688  53.77 
 
 
418 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.33081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4220  protein of unknown function DUF1688  51.5 
 
 
432 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3986  hypothetical protein  50.58 
 
 
434 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2103  hypothetical protein  48.24 
 
 
404 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4571  hypothetical protein  50.92 
 
 
435 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105208  hitchhiker  0.00903491 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2167  hypothetical protein  41.84 
 
 
427 aa  342  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2195  hypothetical protein  40.69 
 
 
427 aa  333  5e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08797  conserved fungal protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09640)  39.22 
 
 
480 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.199708 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00820  conserved hypothetical protein  37.33 
 
 
436 aa  242  9e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>