16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1626 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1626  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  318  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0672235  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2946  hypothetical protein  82.47 
 
 
155 aa  267  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.896453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0218  hypothetical protein  77.92 
 
 
154 aa  255  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3657  hypothetical protein  75.97 
 
 
154 aa  249  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4554  hypothetical protein  71.24 
 
 
155 aa  223  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0706007  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1542  hypothetical protein  70.78 
 
 
159 aa  223  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0091  hypothetical protein  70.13 
 
 
157 aa  223  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2698  hypothetical protein  69.28 
 
 
155 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0894  hypothetical protein  67.97 
 
 
155 aa  213  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263402 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5125  hypothetical protein  44.14 
 
 
184 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8468  hypothetical protein  33.99 
 
 
185 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6975  hypothetical protein  34.03 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1698  hypothetical protein  34.72 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09009  conserved hypothetical protein  31.85 
 
 
180 aa  73.9  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00891  hypothetical protein  44.64 
 
 
226 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2083  anti-ECFsigma factor, ChrR  41.51 
 
 
222 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.246255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>