22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5573 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5573  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1644  hypothetical protein  70.37 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155105  normal  0.206611 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3994  hypothetical protein  70.37 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4373  hypothetical protein  70.37 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29521  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5982  hypothetical protein  70.37 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3787  hypothetical protein  66.67 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565082  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1023  hypothetical protein  63.64 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0182  hypothetical protein  63.64 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2615  hypothetical protein  63.64 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2757  hypothetical protein  63.64 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1326  hypothetical protein  63.64 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0157  hypothetical protein  63.64 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4254  hypothetical protein  73.68 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.204363  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5909  hypothetical protein  53.06 
 
 
83 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0168092  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4874  hypothetical protein  57.14 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0625977  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1096  hypothetical protein  48.15 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.470286  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6191  hypothetical protein  47.27 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.401003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3098  hypothetical protein  55.81 
 
 
58 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.071302  decreased coverage  0.0000094049 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4493  hypothetical protein  52.5 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3130  hypothetical protein  46 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6517  hypothetical protein  44.74 
 
 
61 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398348  normal  0.0924963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5115  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>