15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1698 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1698  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6975  hypothetical protein  77.35 
 
 
183 aa  307  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8468  hypothetical protein  62.43 
 
 
185 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09009  conserved hypothetical protein  45.76 
 
 
180 aa  162  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5125  hypothetical protein  40.8 
 
 
184 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0218  hypothetical protein  33.52 
 
 
154 aa  90.9  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2946  hypothetical protein  36.11 
 
 
155 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.896453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2698  hypothetical protein  36.3 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1542  hypothetical protein  36.62 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3657  hypothetical protein  32.3 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0894  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1626  hypothetical protein  34.72 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0672235  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4554  hypothetical protein  37.32 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0706007  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0091  hypothetical protein  31.98 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0094  hypothetical protein  41.25 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218262  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>