19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6826 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6826  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  183  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5628  hypothetical protein  48.35 
 
 
87 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0337539 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6376  hypothetical protein  46.15 
 
 
87 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436845  normal  0.476784 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5386  hypothetical protein  61.97 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1361  hypothetical protein  50.6 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263213  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6468  hypothetical protein  50.6 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057405  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4884  hypothetical protein  73.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5476  hypothetical protein  73.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  44.12 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  41.79 
 
 
108 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  44.12 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  43.28 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  32.35 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  32.35 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3274  hypothetical protein  32.95 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0310372 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  32.35 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  40.91 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0711  hypothetical protein  44.78 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.438996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1677  hypothetical protein  45.65 
 
 
114 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>