21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5182 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5182  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  174  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870922  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3546  hypothetical protein  67.9 
 
 
91 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0703945  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6474  hypothetical protein  67.06 
 
 
86 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151582  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3192  hypothetical protein  38.2 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0406  hypothetical protein  37.93 
 
 
88 aa  60.1  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1930  hypothetical protein  36.9 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5212  hypothetical protein  34.52 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5720  hypothetical protein  35.29 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470242  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2091  hypothetical protein  33.72 
 
 
90 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395312  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5917  hypothetical protein  35.42 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567263  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1286  hypothetical protein  29.27 
 
 
90 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3216500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2377  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0704345  hitchhiker  0.00399163 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2131  hypothetical protein  31.03 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3576  hypothetical protein  29.76 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.221494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3283  hypothetical protein  34.85 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114531  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4336  hypothetical protein  29.76 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.022904  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1705  hypothetical protein  32.14 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1968  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0894  hypothetical protein  25.29 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00183124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4610  hypothetical protein  25.29 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3282  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237069  normal  0.104172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>