29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4117 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4117  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  244  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7051  hypothetical protein  78.81 
 
 
119 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.646549  normal  0.134521 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0168  hypothetical protein  77.97 
 
 
119 aa  173  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4684  hypothetical protein  50.47 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0693147 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1787  hypothetical protein  49.57 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3650  hypothetical protein  49.57 
 
 
115 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644214  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4377  hypothetical protein  47.86 
 
 
115 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3289  hypothetical protein  47.86 
 
 
115 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139776 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4138  hypothetical protein  47.86 
 
 
115 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4228  hypothetical protein  47.86 
 
 
115 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4124  hypothetical protein  48.72 
 
 
115 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.912588  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1011  hypothetical protein  47.06 
 
 
118 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207786  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1525  hypothetical protein  47.06 
 
 
118 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851693  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0926  hypothetical protein  47.06 
 
 
118 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0090  hypothetical protein  47.06 
 
 
118 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2253  hypothetical protein  47.06 
 
 
118 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1150  hypothetical protein  47.06 
 
 
118 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1743  hypothetical protein  45.97 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6319  hypothetical protein  40.68 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1841  hypothetical protein  39.83 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285691  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2610  hypothetical protein  36.44 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.755906  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2752  hypothetical protein  35.59 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0186  hypothetical protein  35.59 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1020  hypothetical protein  35.59 
 
 
231 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0456  hypothetical protein  36.44 
 
 
142 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0160  hypothetical protein  34.75 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1329  hypothetical protein  34.75 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1141  hypothetical protein  38.33 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5810  hypothetical protein  33.61 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  0.198541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>