22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1871 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1871  GP46 family protein  100 
 
 
405 aa  804    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.881976  hitchhiker  0.000000000000640584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3048  putative bacteriophage protein GP46, Mu-like  69.11 
 
 
149 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162081 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2812  GP46 family protein  46.21 
 
 
151 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1472  phage protein GP46  46.21 
 
 
151 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2734  phage protein GP46  45.45 
 
 
151 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.86914  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3114  GP46 family protein  48.28 
 
 
145 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1045  phage protein GP46  42.52 
 
 
145 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1802  hypothetical protein  34.53 
 
 
502 aa  93.6  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2085  phage protein GP46  42.34 
 
 
149 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3734  phage GP46  51.58 
 
 
155 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2585  phage GP46 family protein  42.99 
 
 
141 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2252  phage protein GP46  44.26 
 
 
137 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2249  phage protein GP46  44.26 
 
 
137 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4480  phage protein GP46  44.26 
 
 
137 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228565 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0742  phage protein GP46  44.76 
 
 
149 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0695  phage protein GP46  44.76 
 
 
149 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2701  hypothetical protein  47.25 
 
 
151 aa  67  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4483  GP46 family protein  39.1 
 
 
150 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.185083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1161  Phage FluMu protein gp46  46.84 
 
 
132 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3861  phage FluMu protein gp46  40.98 
 
 
128 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0890  phage tail protein I  28.86 
 
 
433 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4588  Phage GP46  38.84 
 
 
132 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>