14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0235 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0235  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  803    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2360  hypothetical protein  30.15 
 
 
386 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1186  hypothetical protein  28.35 
 
 
439 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1057  hypothetical protein  37.62 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3160  hypothetical protein  58.33 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44575  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6294  hypothetical protein  45.9 
 
 
455 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5084  hypothetical protein  33.94 
 
 
229 aa  67  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000765562  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1418  hypothetical protein  43.08 
 
 
443 aa  59.7  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5348  hypothetical protein  45.76 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1789  hypothetical protein  21.62 
 
 
424 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3242  hypothetical protein  37.5 
 
 
489 aa  56.6  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3225  hypothetical protein  40.38 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6291  hypothetical protein  37.7 
 
 
425 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5049  hypothetical protein  38.3 
 
 
216 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.567517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>