22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3586 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3586  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0053  hypothetical protein  39.64 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0705  hypothetical protein  40.38 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0323976  normal  0.180125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0694  hypothetical protein  40.38 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1122  hypothetical protein  34.68 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0668  hypothetical protein  38.46 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.307794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6733  hypothetical protein  34.62 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1696  hypothetical protein  30.77 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.0319054 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1033  hypothetical protein  28.44 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1128  hypothetical protein  28.44 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.881437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0268  hypothetical protein  29.81 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4182  hypothetical protein  29.13 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6519  hypothetical protein  30.39 
 
 		 107 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2130  Rhs element Vgr protein  36.89 
 
 		 1007 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2032  Rhs element Vgr protein  36.89 
 
 		 1007 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1680  Rhs element Vgr protein  36.89 
 
 		 1007 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0722  Rhs element Vgr protein  36.89 
 
 		 1007 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0611  Rhs element Vgr protein  36.89 
 
 		 1007 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0583244  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0737  Rhs element Vgr protein  36.89 
 
 		 1007 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1156  hypothetical protein  23.81 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0541  Rhs element Vgr protein  35.92 
 
 		 1007 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0287  hypothetical protein  24.75 
 
 		 122 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>