40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1429 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1429  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  221  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411241  normal  0.655732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0588  hypothetical protein  75.45 
 
 		 110 aa  150  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147251  normal  0.641101 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4646  integral membrane protein-like  66.98 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3131  hypothetical protein  75.44 
 
 		 98 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0758  hypothetical protein  63.38 
 
 		 96 aa  93.6  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306085  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6304  hypothetical protein  64.52 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4685  hypothetical protein  65.52 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.238421  normal  0.819427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3391  hypothetical protein  47.22 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2033  hypothetical protein  68.42 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.230623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2191  hypothetical protein  65.52 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  normal  0.810634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1243  hypothetical protein  56.16 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0304  hypothetical protein  57.14 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237278 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5939  hypothetical protein  68.42 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.822986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2029  hypothetical protein  68.97 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3065  hypothetical protein  62.07 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.516609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1608  integral membrane protein-like  67.8 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1030  hypothetical protein  54.17 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.89878 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5129  hypothetical protein  57.75 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1722  hypothetical protein  63.49 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.685505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0774  hypothetical protein  64.91 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.754477  normal  0.205049 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5147  hypothetical protein  65.52 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0993  hypothetical protein  60.34 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1558  hypothetical protein  67.35 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0381215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3132  hypothetical protein  39.81 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0945  putative signal peptide protein  53.45 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.461777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1619  hypothetical protein  44.83 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1614  hypothetical protein  44.83 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4791  hypothetical protein  36.08 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0812  hypothetical protein  53.19 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114629  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002085  putative signal peptide protein  46.3 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02371  signal peptide protein  48.94 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.352612  normal  0.0437387 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00352  hypothetical protein  46.81 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1005  putative signal peptide protein  36.67 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4292  putative signal peptide protein  45.45 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4402  signal peptide protein  45.45 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2687  signal peptide protein  44.68 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13267  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0729  hypothetical protein  45.83 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2358  putative signal peptide protein  42.55 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0709  hypothetical protein  43.75 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0845  hypothetical protein  39.66 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>