15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0411 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0411  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  406  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.515646  normal  0.176286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2347  hypothetical protein  51.03 
 
 
202 aa  209  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.80228  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0105  hypothetical protein  50.52 
 
 
195 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5910  hypothetical protein  48.47 
 
 
202 aa  201  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8911  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1463  hypothetical protein  50.26 
 
 
202 aa  201  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1228  hypothetical protein  48.73 
 
 
197 aa  201  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1510  hypothetical protein  48.73 
 
 
197 aa  201  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0590557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1428  hypothetical protein  47.94 
 
 
196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3649  hypothetical protein  49.48 
 
 
196 aa  195  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7807  hypothetical protein  47.42 
 
 
275 aa  194  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7752  hypothetical protein  47.67 
 
 
275 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384713  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1889  hypothetical protein  38.92 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.887435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1785  hypothetical protein  36.76 
 
 
176 aa  134  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0077  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  94.7  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.541745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1175  hypothetical protein  31.69 
 
 
179 aa  92.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>