13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31820 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_31820  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  701    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04420  hypothetical protein  46.76 
 
 
378 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129632  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28850  hypothetical protein  34.74 
 
 
391 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.190647 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4332  hypothetical protein  45.75 
 
 
165 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4444  hypothetical protein  29.27 
 
 
363 aa  123  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4428  hypothetical protein  29.27 
 
 
375 aa  123  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2199  hypothetical protein  26.63 
 
 
369 aa  107  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1118  hypothetical protein  29.31 
 
 
354 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301061  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07200  hypothetical protein  29 
 
 
434 aa  104  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0643  hypothetical protein  29.11 
 
 
550 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.24252  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3460  hypothetical protein  29.04 
 
 
386 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1137  hypothetical protein  24.84 
 
 
436 aa  46.6  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2887  hypothetical protein  25.73 
 
 
398 aa  43.5  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.286834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>