19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28880 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28880  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  754    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.166102  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28890  hypothetical protein  33.64 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0662  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.56 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0858  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.93 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0459016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4325  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.16 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2920  hypothetical protein  26.74 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4616  metalloprotease-like protein  29.27 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0857  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.11 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1467  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  22.28 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4326  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.92 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2919  metalloprotease  26.86 
 
 		 319 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10350  predicted metalloprotease  29.34 
 
 		 322 aa  52.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.996596  normal  0.0302489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1876  hypothetical protein  25.73 
 
 		 372 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.425514  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3415  metalloprotease-like protein  23.32 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154601  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4034  metalloprotease-like protein  25.52 
 
 		 266 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096293  normal  0.0588825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8699  hypothetical protein  25.3 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0930  metalloprotease-like protein  23.56 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8759  hypothetical protein  22.46 
 
 		 261 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6735  metalloprotease-like protein  23.93 
 
 		 287 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331634  normal  0.274801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>