17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20770 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_20770  hypothetical protein  100 
 
 
560 aa  1062    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0250367  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2345  hypothetical protein  34.34 
 
 
507 aa  118  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.274272  hitchhiker  0.00000585461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1265  hypothetical protein  27.5 
 
 
558 aa  110  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000106204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1208  hypothetical protein  32.97 
 
 
528 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09080  hypothetical protein  32.3 
 
 
574 aa  96.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.391282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1194  hypothetical protein  27.53 
 
 
577 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2547  hypothetical protein  31.69 
 
 
538 aa  95.5  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1859  hypothetical protein  29.04 
 
 
623 aa  95.5  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.163853  normal  0.0142355 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0759  hypothetical protein  23.62 
 
 
513 aa  73.9  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.13019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0753  hypothetical protein  25.08 
 
 
489 aa  64.7  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0387662 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0461  hypothetical protein  30.46 
 
 
513 aa  64.3  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.274744  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4066  hypothetical protein  28.89 
 
 
601 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1384  hypothetical protein  26.76 
 
 
471 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2513  hypothetical protein  28.01 
 
 
471 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1413  hypothetical protein  30.18 
 
 
475 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0668579  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0591  hypothetical protein  21.69 
 
 
528 aa  46.2  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.373407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  29.13 
 
 
222 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.469068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>