26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20080 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20080  protein of unknown function (DUF2017)  100 
 
 		 211 aa  407  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0919227  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2740  hypothetical protein  35.81 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2584  hypothetical protein  36.31 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1724  hypothetical protein  30 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1690  hypothetical protein  44.55 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0379903  hitchhiker  0.00000515175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2371  hypothetical protein  34.75 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0935  hypothetical protein  29.86 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  0.761399 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1322  Domain of unknown function DUF2017  37.23 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.134617  hitchhiker  0.00216166 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2316  hypothetical protein  34.51 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0988  hypothetical protein  35.9 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278461  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1491  hypothetical protein  36.75 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3874  hypothetical protein  34.34 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1057  hypothetical protein  31.11 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1099  hypothetical protein  35.48 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.623925  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08340  hypothetical protein  35.97 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3765  hypothetical protein  27.8 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10710  hypothetical protein  32.88 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0355904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0884  hypothetical protein  32.97 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1006  hypothetical protein  27.52 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29220  protein of unknown function (DUF2017)  25.12 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.942758  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25080  hypothetical protein  33.11 
 
 		 278 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1354  Domain of unknown function DUF2017  40 
 
 		 165 aa  45.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5655  hypothetical protein  32.34 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1695  hypothetical protein  28.02 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185996  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1870  hypothetical protein  29.81 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087636  normal  0.127946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>