22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14750 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_14750  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  317  3.9999999999999996e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.361385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4277  hypothetical protein  43.42 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.333578 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2264  hypothetical protein  39.88 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3003  hypothetical protein  38.81 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2001  hypothetical protein  36.94 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124511 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12600  hypothetical protein  41.61 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0565366  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15570  hypothetical protein  37.24 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.581223  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1323  hypothetical protein  32.3 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.248263 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2036  hypothetical protein  40.41 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5243  hypothetical protein  35.06 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1710  hypothetical protein  44.63 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0354776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17980  hypothetical protein  35.8 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2403  hypothetical protein  32.86 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1844  hypothetical protein  40.31 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.933293  normal  0.367059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2338  hypothetical protein  37.1 
 
 
184 aa  63.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2662  putative export or membrane protein  32.24 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3745  putative export or membrane protein  32.68 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291225  normal  0.0249231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2365  putative export or membrane protein  32.05 
 
 
166 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2412  putative export or membrane protein  32.05 
 
 
166 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2406  putative export or membrane protein  32.05 
 
 
166 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474426  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11411  hypothetical protein  34.46 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0169137  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2583  hypothetical protein  30.36 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>