19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1230 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1230  polyhydroxyalkanoic acid synthase, PhaR subunit  100 
 
 
160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1367  phaR protein  97.5 
 
 
160 aa  311  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.152883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3977  phaR protein  96.88 
 
 
160 aa  311  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1208  PHA synthase subunit PhaR; regulator of PhaP  95.62 
 
 
160 aa  306  8e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00647485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1229  phaR protein  95 
 
 
160 aa  304  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.705395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1329  phaR protein  95 
 
 
160 aa  304  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1428  phaR protein  95 
 
 
160 aa  304  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1469  phaR protein  95 
 
 
160 aa  304  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1206  PHA synthase subunit PhaR; regulator of PhaP  95 
 
 
160 aa  303  7e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1404  phaR protein  94.38 
 
 
160 aa  302  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1042  polyhydroxyalkanoic acid synthase, PhaR subunit  85 
 
 
160 aa  271  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4554  hypothetical protein  27.21 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0106  hypothetical protein  28.76 
 
 
200 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2384  E3 binding protein  29.63 
 
 
298 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0628  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1243  hypothetical protein  30.08 
 
 
187 aa  54.3  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3550  hypothetical protein  26.61 
 
 
121 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1098  hypothetical protein  28.74 
 
 
200 aa  48.5  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1821  hypothetical protein  23.15 
 
 
112 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.338762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>