12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1040 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1040  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  410  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188529  normal  0.0259839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3068  hypothetical protein  40.7 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  hitchhiker  0.0000897866 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2097  hypothetical protein  38.95 
 
 
174 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153815  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4925  hypothetical protein  25.74 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.762389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1168  hypothetical protein  35.71 
 
 
251 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1662  hypothetical protein  30.38 
 
 
248 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222644  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3779  hypothetical protein  32.63 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3355  hypothetical protein  32.63 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2907  hypothetical protein  25.37 
 
 
202 aa  45.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1247  hypothetical protein  26.7 
 
 
199 aa  45.1  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4691  hypothetical protein  34.62 
 
 
282 aa  41.6  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.485006  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2259  hypothetical protein  31.46 
 
 
259 aa  41.2  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.338254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>