37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0740 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  100 
 
 		 532 aa  1054    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  58.38 
 
 		 526 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  57.26 
 
 		 487 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  39.36 
 
 		 581 aa  277  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0394  GH3 auxin-responsive promoter  33.27 
 
 		 547 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.20196  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  27.99 
 
 		 559 aa  143  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  26.08 
 
 		 586 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  24.55 
 
 		 557 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  27.42 
 
 		 417 aa  86.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  23.22 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2176  hypothetical protein  21.96 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  22.76 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  22.44 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  21.82 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  23.38 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  22.87 
 
 		 507 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  21.79 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  21.71 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  28.14 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  20.79 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  20.79 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  23.02 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  19.62 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  19.49 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  26.06 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  31.07 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  28.06 
 
 		 497 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  30.86 
 
 		 528 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  27.08 
 
 		 502 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  32.22 
 
 		 507 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  31.34 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  21.13 
 
 		 521 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  34.02 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  34.02 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  21.93 
 
 		 510 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  27.15 
 
 		 527 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>