16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5925 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5925  putative type III secretion apparatus protein  100 
 
 		 338 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0672  secretion-associated protein  42.64 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2274  putative type III secretion apparatus protein  42.64 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2192  putative type III secretion apparatus protein  42.64 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237155  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0758  serine protease  41.96 
 
 		 335 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5647  SctD; secretion-associated protein  34.77 
 
 		 361 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0177431 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5864  sctD; secretion-associated protein  35.04 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1912  putative secretion-associated protein  36.39 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2004  secretion-associated protein  35.91 
 
 		 349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0432  secretion-associated protein  35.91 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0473  secretion-associated protein  32.38 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1961  transmembrane protein  41.9 
 
 		 207 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1960  type III secretion inner membrane protein  48.67 
 
 		 125 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0857  HRPW transmembrane protein  25.76 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0240135 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03409  HrpD5  30.38 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2207  type III secretion apparatus protein, YscD/HrpQ family  28.14 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>