37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4515 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 526 aa  1054    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  57.36 
 
 		 532 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  52.67 
 
 		 487 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  40.88 
 
 		 581 aa  303  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0394  GH3 auxin-responsive promoter  32.21 
 
 		 547 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.20196  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  27.52 
 
 		 559 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  25.83 
 
 		 586 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  29.18 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  26.64 
 
 		 557 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  22.56 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  20.91 
 
 		 502 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2176  hypothetical protein  24.58 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  23.43 
 
 		 508 aa  77  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  23.02 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  29.71 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  22.5 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  31.96 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  20.51 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  27.33 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  31 
 
 		 507 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  28.71 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  27.46 
 
 		 497 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  30 
 
 		 504 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  26.19 
 
 		 562 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  28 
 
 		 504 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  23.66 
 
 		 509 aa  53.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  24.7 
 
 		 527 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  26.24 
 
 		 497 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  26.25 
 
 		 530 aa  47.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  31.03 
 
 		 496 aa  47.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  27.93 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  28.92 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  27.78 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  29.89 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  24.11 
 
 		 539 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  19.22 
 
 		 521 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>