14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3450 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3450  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  304  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228768  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4293  hypothetical protein  90.67 
 
 
160 aa  275  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.910498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4073  hypothetical protein  90.67 
 
 
150 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1967  hypothetical protein  79.87 
 
 
150 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.878388  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6521  hypothetical protein  43.59 
 
 
125 aa  90.5  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1188  hypothetical protein  50.53 
 
 
97 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1631  hypothetical protein  33.85 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000804863  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0147  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  29.63 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28200  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050944  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4056  hypothetical protein  27.74 
 
 
241 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2145  hypothetical protein  31.11 
 
 
204 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3073  hypothetical protein  29.45 
 
 
312 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3190  hypothetical protein  28.77 
 
 
349 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0127935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>