28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3390 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3390  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  318  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.898354 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4237  hypothetical protein  98.79 
 
 
165 aa  314  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4129  hypothetical protein  98.79 
 
 
165 aa  314  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.402697  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1906  hypothetical protein  86.84 
 
 
165 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74595  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4463  hypothetical protein  76.62 
 
 
162 aa  231  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0446649  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0422  hypothetical protein  56.88 
 
 
161 aa  175  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2683  hypothetical protein  56.05 
 
 
164 aa  167  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.570135  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01185  hypothetical protein  52.98 
 
 
161 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1716  hypothetical protein  61.03 
 
 
167 aa  164  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3271  hypothetical protein  61.11 
 
 
173 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1856  hypothetical protein  61.11 
 
 
173 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39497  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2696  hypothetical protein  61.11 
 
 
173 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2903  hypothetical protein  54.61 
 
 
167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0037  hypothetical protein  60.42 
 
 
173 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0250  hypothetical protein  60.42 
 
 
173 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0037  hypothetical protein  60.42 
 
 
173 aa  160  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000247  permease  48.1 
 
 
167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3348  hypothetical protein  52.78 
 
 
163 aa  147  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3588  hypothetical protein  49.67 
 
 
161 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1862  hypothetical protein  45.33 
 
 
158 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588861  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1681  hypothetical protein  45.33 
 
 
159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3836  hypothetical protein  49.07 
 
 
162 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437346  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1596  hypothetical protein  49.69 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4272  hypothetical protein  48.45 
 
 
185 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00090  predicted membrane protein  38 
 
 
159 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3769  hypothetical protein  37.97 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1783  hypothetical protein  39.73 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119628  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3786  hypothetical protein  35.14 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0426513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>