13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4293 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4293  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.910498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4073  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3450  hypothetical protein  90.67 
 
 
150 aa  275  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228768  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1967  hypothetical protein  81.88 
 
 
150 aa  246  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.878388  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1188  hypothetical protein  53.68 
 
 
97 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6521  hypothetical protein  40.87 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1631  hypothetical protein  35.78 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000804863  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0147  hypothetical protein  32.58 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  28.15 
 
 
232 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28200  hypothetical protein  39.08 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050944  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4056  hypothetical protein  28.85 
 
 
241 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2145  hypothetical protein  31.11 
 
 
204 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3190  hypothetical protein  28.89 
 
 
349 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0127935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>