21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4172 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4194  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4172  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.668567  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3323  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1829  hypothetical protein  90.48 
 
 
192 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5022  hypothetical protein  36.14 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00332946  normal  0.0559507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2699  hypothetical protein  35.83 
 
 
203 aa  91.3  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2016  hypothetical protein  29.19 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.664409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1798  hypothetical protein  28.26 
 
 
182 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.880699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1938  hypothetical protein  28.26 
 
 
182 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3588  hypothetical protein  30.81 
 
 
185 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0355167 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1755  hypothetical protein  27.72 
 
 
182 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.961284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2037  hypothetical protein  27.72 
 
 
179 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.291889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1772  hypothetical protein  26.88 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0436787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1430  hypothetical protein  31.25 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3287  hypothetical protein  27.32 
 
 
183 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1470  hypothetical protein  28.42 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1750  hypothetical protein  26.09 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0127441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1973  hypothetical protein  26.04 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22827e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3405  hypothetical protein  26.01 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112868 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1937  hypothetical protein  22.81 
 
 
167 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0956  hypothetical protein  29.81 
 
 
107 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>