17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5419 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4850  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5419  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257905  normal  0.0113948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5443  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0233  hypothetical protein  77.66 
 
 
197 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4760  hypothetical protein  78.68 
 
 
219 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.785775  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5306  hypothetical protein  79.19 
 
 
197 aa  305  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2655  hypothetical protein  50.52 
 
 
213 aa  191  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00248341  unclonable  0.0000000268429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3494  hypothetical protein  35.23 
 
 
195 aa  134  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2964  hypothetical protein  43.1 
 
 
190 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2486  hypothetical protein  42.05 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0273408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0544  hypothetical protein  41.38 
 
 
185 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1063  hypothetical protein  38.29 
 
 
188 aa  97.8  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0325013  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1709  hypothetical protein  38.15 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0426  hypothetical protein  42.29 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125949  hitchhiker  0.0000334915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70220  hypothetical protein  60.87 
 
 
63 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1128  hypothetical protein  47.46 
 
 
64 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00652499  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4265  hypothetical protein  27.11 
 
 
455 aa  45.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.045316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>